宇宙世紀(jì)0068年，居住在SIDE3的慕佐自治共和國(guó)議長(zhǎng)發(fā)表完《完全獨(dú)立宣言》后意外身亡，由此引發(fā)了連番的動(dòng)亂，許多人的命運(yùn)也就此發(fā)生根本轉(zhuǎn)變。轉(zhuǎn)眼來(lái)到宇宙世紀(jì)0074年，愛(ài)德華·瑪斯（池田秀一 配音）以夏亞·阿茲納布的身份進(jìn)入吉恩自治共和國(guó)國(guó)防軍官學(xué)校學(xué)習(xí)。在那里，他與來(lái)自SIDE3的名門(mén)子弟格爾瑪（柿原徹也 飾）互相賞識(shí)，成為模擬好友。
宇宙世紀(jì)0077年，學(xué)生們揭竿而起，發(fā)起了針對(duì)地球聯(lián)邦軍的武裝起義。對(duì)夏亞來(lái)說(shuō)，他的復(fù)仇也由此拉開(kāi)序幕……